我们有一个链，链条上有不同的小零件。把链条放进水里一泡，它便会自己组装成一个三维结构——这条链叫肽链，而链条的组装就叫蛋白质的折叠。小零件的顺序几乎完全决定了三维结构，所以根据零件顺序预测三维结构便成了避不开的话题。
三维结构怎么表示呢？一般使用分子坐标，即，一个预测要给出所有非氢原子的三维笛卡尔坐标和对该位置的置信度估计。
AlphaFold 1 认为，如果把链上的这一个个氨基酸残基当成刚性的小零件，那么对于每一个氨基酸而言，只要给定它的坐标，那么三维结构就解析了出来，至于侧链原子的预测就简单不少。那我们就先只考虑怎么把一条肽链堆起来组装成一个蛋白质。
如果我们认为 Transformer 能理解文意与文法，那我们也不妨假定 Transformer 能理解基因之间的关系。如果文字能变成 token 喂进 Transformer 训练，然后吐出文字，那基因和它的表达量也可以喂进 Transformer 训练，然后吐出未知表达量基因的表达量。
scGPT 是一个预训练模型。换而言之就是，我们认为它对细胞内的情况了解得不错，所以它既能直接被拿来生成其他的基因，又能在输出层的位置加点东西改装一下，然后通过微调完成其他的生物学任务。
上一回我们通过修改 MTU 的方式解决了无法通过 curl 下载和无法连接学校内网的问题。这让我对网络代理，尤其是 Clash Verge 的 TUN 模式，有了不少兴趣。不过由于时间关系，也一直没来得及学。
恰好最近又遇到一堆网络问题，正好趁着解决这些问题的机会把 Clash Verge 弄明白一点，重整所有的 Clash Verge 配置，也方便以后的各种工作。
我真的很喜欢熬夜，尤其是在手头上有一堆事情要干的时候，比如一整个高三，再比如正在经历的期末周。虽然常常希望熬夜时顺便学点知识，或写几道题，至少为《哲学导论B》读几本经典的书，可事实上我并不做什么事。我并不会多学一点，也没有多写一点作业，甚至不会翻动哪怕一页小说。时间都到哪儿去了呢？可能是 Tung Tung Tung Sahur，可能是张雪峰老师我还记得你，更可能是 IEM 科隆 2026 反对罢工 2 锦标赛。
到这里，我们或许还能辩解，熬夜的主要原因是弥补白天缺少的快乐。然而似乎也不是。我发现，如果我老老实实地一点睡觉八点起，我将会获得饱满的一天；而如果我四点睡觉十一点起，起床后我的脑子还是很糊涂。饱满的一天给人带来的满足感远不是熬夜的那三个小时能比的。而且算算账单，熬夜并不会让我多出来三个小时娱乐时间，它只是挪用了第二天的时间。甚至，那三个小时都不一定能算娱乐–如果恰好看到一场气得人肝火直冒的变态比赛的话。
按照理性看我应该立刻停止熬夜。可我没有。我还是每天四点睡觉。通常来讲，我的理性还算强大，不过这次它输了。好像还有上次、上上次……好吧，它一直在输。
Windows 不适合作为开发系统。这个结论的得出经过了好大一番波折，不过可以肯定基本上是个可靠的结论。
这番波折的起因要怪我手贱把明明已经被组策略阻断更新的 Windows 系统升级到了 24H2。升级完一看，坏了——硬盘的权限被改动，读写增删都变麻烦很多。捣鼓半天终于把 D 盘的权限搞了回来，以为回到舒适的操作环境了，结果又发现不对——OpenCode 的 @ 功能老是出岔子。对比实验一番，发现在权限全部属于自己的 D 盘上就没这问题，但到了没改回来权限的 C 盘上就有问题。咋办？改 C 盘权限呗！
结论是千万不要右击本地磁盘(C:)然后依次点击属性-安全-高级-更改，然后输入用户名点击确认，再勾选“替换子容器和对象的所有者”，最后点击确认啊！C 盘的权限是不能瞎改的！
瞎改的结果是 Edge 整个崩溃，WebView2 框架完全用不了，每次开机还都要先点掉几个错误提示。而且，Clash Verge 用的是 WebView2 框架，导致我完全看不了它的界面。一点都忍不了了，重装系统吧。唯一还算令人感动的要点是我用 Scoop 管理着不少应用程序，而且把 Scoop 本体和没法用 Scoop 管理的大部分应用程序都安装到了 D 盘。这使得重装就轻松很多。
这一次重装也正好是一个断舍离的机会。我决定把工作环境整个挪到 Linux 上。在学校社团群同侪们的建议下，也结合我没法立刻完全脱离 Windows 环境的考量，我最终选择了交互方便、即开即用的 WSL。
这个系列就是记录我在玩 WSL 时遇到的一些小问题，也是我杂记的第一篇。杂记不一定要遇到什么问题，即使遇到了什么问题也不一定记下什么解答，不过作为兴起兴落后的余韵罢了。虽然这么说，不过好消息是这次是有解决方法的。
当我们翻开《卡拉马佐夫兄弟》，我们究竟在阅读什么？我想，这部宏大的著作从根本上探讨了一个从当时持续到现在的问题：当上帝离场时，当道德相对时，我们将何去何从？
在书中，佐西马长老的死不仅仅是一个情节的转折，更代表着上帝在场与离场的分界线。当预期的肉身不腐落空，上帝便不再以神迹来为信仰背书，而是将人类抛入了一个道德相对、结论不明的自由之境。这种"离场"无情地剥夺了平庸大众赖以安宁的世俗保障，迫使每一个独立的灵魂必须独自去承担认识善恶的痛苦。
塔罗牌总计78张，其中有22张大牌和56张小牌。这是一个很大的量，意味着用塔罗牌占卜前一定要经过一个熟习牌意的小门槛。或许初学时还能通过牌面分析巧记牌意，然而，当往神秘学世界进一步探索、想研究塔罗牌的对应占星关系时，记忆便变得毫无取巧之法可言。
……是这样吗？
神秘学不是反逻辑的。它是有迹可循的。在我的上一篇笔记（也是合集的第一篇笔记）《大阿卡纳牌的占星原理》中，我们就详细拆解了每张大阿卡纳牌的占星原理。而这篇笔记中，我将和你一起走入小阿卡纳牌的占星世界。
如果你点开了这个帖子，屏幕另一边的你大概不是一名入门级别的塔罗“爱好者”。你大概能把二十二张大阿卡纳牌的牌意倒背如流，再不济也滚瓜烂熟了。
为了精进自己的占卜技巧，或只是单纯出于热爱，无论如何，你决定挖一点更深入的神秘学知识。于是你搜索了大阿卡纳牌的对应占星，决定把它们记上一记。然而，在看到大阿卡纳牌与行星、星座的一一对应关系时，你傻了眼——
咋这么混乱？这我记个集贸啊！
当我还是一名初心塔罗师时，我也遇上了同样的困境。不要着急，这篇帖子不仅会引导你背下来大阿卡纳牌与行星、星座的一一对应关系，而且将帮助你更好地理解什么是塔罗。
让我们开始吧。